Software de facturación para tiendas online y ecommerce

Si gestionas una tienda online en España (Shopify, WooCommerce, PrestaShop, Magento, BigCommerce, propia), la facturación tiene matices: integración con la plataforma, IVA por país en UE, gestión de stock, devoluciones y rectificativas, y cumplimiento Verifactu. Este artículo te orienta.

Para contexto, ten a mano la pillar paquete básico.

Lo que necesita un ecommerce

A diferencia de un comercio físico:

• Facturación automática desde la plataforma ecommerce (no manual factura a factura).
• Cumplimiento Verifactu.
• IVA correcto por destinatario: España, UE (régimen OSS si aplica), fuera UE (sin IVA).
• Gestión de devoluciones con rectificativas.
• Stock sincronizado con la plataforma.
• Multi-divisa si vendes a fuera de España.
• Múltiples métodos de pago: tarjeta, PayPal, Bizum, transferencia.

Integración ecommerce + facturación

El flujo típico:

1. Cliente realiza compra en tu Shopify/WooCommerce.
2. Sistema ecommerce confirma pago y envía notificación.
3. Software de facturación recibe el pedido vía integración (API, plugin).
4. Genera factura automáticamente con datos del cliente, productos, IVA correcto.
5. Registra en Verifactu (hash, QR, envío AEAT).
6. Envía factura por email al cliente.

Sin integración, hay que hacer factura a factura manualmente — no escala con volumen.

Verifactu y ecommerce

Tu fecha:

• SL: enero 2026 (en vigor).
• Autónomo en estimación directa: enero 2027.

Las facturas simplificadas a particulares (tickets de tu ecommerce) también se registran en Verifactu. Tu software debe gestionarlas igual que las completas.

IVA: el matiz por país

Ventas B2C a clientes UE

• Por debajo de 10.000 €/año total UE: aplicas IVA español 21% (o el que aplique al producto).
• Por encima: te inscribes en OSS (One Stop Shop) y aplicas el IVA del país del comprador. Italia 22%, Francia 20%, etc.

Ventas B2B a empresas UE con NIF VIES

Sin IVA por inversión del sujeto pasivo. Necesitas estar en ROI. Detalle en cómo darte de alta en el ROI.

Ventas fuera UE (EE.UU., Reino Unido, etc.)

Sin IVA. Operación de exportación. Detalle en cómo facturar a cliente extranjero fuera UE.

Tu software debe detectar automáticamente el país del comprador y aplicar la regla correcta. Productos como Holded, Quipu en planes premium, Odoo, gestionan esto bien con configuración inicial.

Opciones del mercado

Software genérico Verifactu con integración ecommerce

Holded (integración Shopify, WooCommerce, PrestaShop), Odoo (integraciones nativas y vía Zapier), Sage 50 (integraciones).

Pros: facturación + ecommerce automatizado. Contras: precio plan medio-superior.

Coste: 600-2.000 €/año + plugin/integración.

Software sectorial ecommerce

Sellsy, Quaderno, Stripe Tax: específicos para SaaS y ecommerce con foco en gestión de IVA internacional.

Pros: cobertura excelente de IVA por país, automatización OSS. Contras: precio significativo, suele ser para volúmenes mayores.

Combinación plugin nativo + software facturación

Algunos plugins de Shopify/WooCommerce conectan directamente con software de facturación español (plugin “Holded para WooCommerce”, plugin “Quipu Connect”).

Pros: instalación rápida. Contras: pueden tener limitaciones según plan.

Casos prácticos

Tienda Shopify autónomo individual con 50-200 pedidos/mes

Recomendación: Holded plan medio + plugin Shopify.

Coste: 60-90 €/mes (≈ 720-1.080 €/año).

Ecommerce WooCommerce con 200-500 pedidos/mes y ventas a UE

Recomendación: Odoo (paquete básico personalizado) o Holded plan profesional con OSS.

Coste: 100-300 €/mes setup + mantenimiento.

Marketplace propio o tienda con 1.000+ pedidos/mes

Recomendación: Odoo Enterprise con módulo ecommerce nativo o Sage 200 personalizado.

Coste: 3.000+ €/año.

Devoluciones y rectificativas

Una particularidad ecommerce: devoluciones frecuentes. El proceso correcto:

1. Cliente solicita devolución.
2. Recibes la mercancía.
3. Emites factura rectificativa por el importe devuelto.
4. Reembolsas al cliente.

Tu software de facturación debe permitir crear rectificativa desde la factura original con un click. Detalle en cómo emitir factura rectificativa.

Sincronización de stock

Si vendes producto físico, el stock es crítico. Cada pedido confirmado debe descontar de stock automáticamente. Soluciones:

• Plataforma ecommerce gestiona stock: Shopify, WooCommerce, PrestaShop tienen módulos nativos de inventario. El software de facturación lee solo los pedidos.
• Software de facturación gestiona stock: Odoo POS y Holded tienen módulos de inventario. La plataforma actúa como escaparate y el stock vive en el ERP.
• Integración bidireccional: stock en ambos sistemas sincronizado en tiempo real (más complejo).

Para tiendas con un solo canal de venta, basta con que la plataforma gestione el stock. Para tiendas omnicanal (online + físico), un ERP que centralice es preferible.

Errores frecuentes

”Genero las facturas manualmente desde la plataforma”

Para 5-10 pedidos al mes es viable. Para volumen mayor, automatización imprescindible: ahorras horas y eliminas errores de tipeo.

”No pido NIF al cliente B2C”

Es lo correcto: la factura simplificada a particular no requiere NIF. Pero si un cliente lo pide para deducir IVA empresa, tu sistema debe permitir convertir el ticket en factura ordinaria.

”Aplico siempre IVA español 21% por simplicidad”

Si vendes a UE B2B con NIF VIES o a fuera UE, no aplica IVA español. Cargarlo es error: penalizas a tu cliente y declaras IVA que no corresponde.

Conclusión

Para tienda online en España, el software de facturación debe integrar con tu plataforma ecommerce, cumplir Verifactu, gestionar IVA correctamente según país del comprador, y manejar devoluciones con rectificativas.

Verifica que tu solución:

• Tiene integración con tu plataforma (Shopify, WooCommerce, etc.).
• Cumple Verifactu.
• Gestiona IVA OSS si vendes a UE.
• Permite rectificativas para devoluciones.

Si valoras una solución on-premise con datos en tu PC y prefieres flexibilidad de personalización, nuestro paquete básico basado en Odoo es punto de partida razonable. Cuéntanos qué plataforma usas y vemos qué encaja.